Οι Ειδικοί Τομεακοί Γραμματείς τίθενται επικεφαλής της διοικητικής ιεραρχίας των ενιαίων διοικητικών τομέων του άρθρου 53 του Κώδικα Νομοθεσίας για την Κυβέρνηση και τα κυβερνητικά όργανα (π.δ. 63/2005) και των Ειδικών Γραμματειών που έχουν συσταθεί με άλλες διατάξεις και στο πλαίσιο αυτό ασκούν κατ’ ανάλογη εφαρμογή τις αρμοδιότητες του άρθρου 5 του παρόντος.