Τα έξοδα ανά Υπουργείο, Αποκεντρωμένη Διοίκηση και Περιφερειακή Υπηρεσία Υπουργείου οικονομικού έτους 2016, ορίζονται ως ακολούθως:
| Τακτικός προϋπολογισμός | Προϋπολογισμός Δημοσίων Επενδύσεων | Γενικό σύνολο | |
| Έξοδα | 583.281.567.000 | 6.750.000.000 | 590.031.567.000 |
| Υπουργεία | 583.080.346.000 | 6.750.000.000 | 589.830.346.000 |
| Προεδρία Δημοκρατίας | 3.294.000 | 3.294.000 | |
| Βουλή των Ελλήνων | 136.016.000 | 2.000.000 | 138.016.000 |
| Εσωτερικών και Διοικητικής Ανασυγκρότησης | 5.246.117.000 | 340.000.000 | 5.586.117.000 |
| Εξωτερικών | 258.285.000 | 9.000.000 | 267.285.000 |
| Εθνικής Άμυνας | 3.185.300.000 | 16.000.000 | 3.201.300.000 |
| Υγείας | 4.317.241.000 | 80.000.000 | 4.397.241.000 |
| Δικαιοσύνης, Διαφάνειας και Ανθρωπίνων Δικαιωμάτων | 577.913.000 | 12.000.000 | 589.913.000 |
| Παιδείας, Έρευνας και Θρησκευμάτων | 4.274.000.000 | 590.000.000 | 4.864.000.000 |
| Πολιτισμού και Αθλητισμού | 281.000.000 | 102.000.000 | 383.000.000 |
| Οικονομικών | 551.172.568.000 | 15.000.000 | 551.187.568.000 |
| Αγροτικής Ανάπτυξης και Τροφίμων | 631.865.000 | 603.000.000 | 1.234.865.000 |
| Περιβάλλοντος και Ενέργειας | 53.928.000 | 410.000.000 | 463.928.000 |
| Εργασίας, Κοινωνικής Ασφάλισης και Κοινωνικής Αλληλεγγύης | 11.971.620.000 | 380.000.000 | 12.351.620.000 |
| Οικονομίας, Ανάπτυξης καιΤουρισμού | 80.196.000 | 2.061.000.000 | 2.141.196.000 |
| Υποδομών, Μεταφορών και Δικτύων | 570.343.000 | 2.093.000.000 | 2.633.343.000 |
| Ναυτιλίας και Νησιωτικής Πολιτικής | 320.660.000 | 37.000.000 | 357.660.000 |
| Αποκεντρωμένες Διοικήσεις | 168.390.000 | 168.390.000 | |
| Αττικής | 20.264.000 | 20.264.000 | |
| Θεσσαλίας - Στερεάς Ελλάδας | 28.465.000 | 28.465.000 | |
| Ηπείρου - Δυτικής Μακεδονίας | 18.392.000 | 18.392.000 | |
| Πελοποννήσου - Δυτικής Ελλάδας και Ιονίου | 34.499.000 | 34.499.000 | |
| Αιγαίου | 10.170.000 | 10.170.000 | |
| Κρήτης | 10.619.000 | 10.619.000 | |
| Μακεδονίας - Θράκης | 45.441.000 | 45.441.000 | |
| Περιφερειακές Υπηρεσίες Υπουργείων | 32.831.000 | 32.831.000 | |
| Περιφερειακές Υπηρεσίες Υπουργείου Παιδείας, Έρευνας και Θρησκευμάτων | 12.000.000 | 12.000.000 | |
| Περιφερειακές Υπηρεσίες Υπουργείου Οικονομικών | 20.831.000 | 20.831.000 |
