Σε κάθε περίπτωση που ΜΙΥΑ υποβάλει αίτηση αδειοδότησης ή ανανέωσης της άδειας ή τροποποίησης/συμπλήρωσης των υποβαλλόμενων στοιχείων της, στον έλεγχο της ακρίβειας, ορθότητας και πληρότητας της αίτησης και του φακέλου των δικαιολογητικών και προσκομιζόμενων εγγράφων προβαίνει τριμελής επιτροπή απαρτιζόμενη από μέλη της ΕΑΙΥΑ που ορίζονται με απόφαση του Προέδρου ή Αντιπροέδρου αυτής. Τα μέλη της προαναφερόμενης Επιτροπής μπορεί να διενεργούν και επιτόπιο έλεγχο - αυτοψία, αυτοπροσώπως ή επικουρούμενα από μέλη άλλων υπηρεσιών και δημοσίων αρχών δυνάμει του άρθ. 22 παρ. 7 Ν. 3305/2005. Επίσης, μπορούν να ζητούν επιπλέον διευκρινίσεις, έγγραφα και στοιχεία, απαραίτητα για τον έλεγχο και τη χορήγηση της σχετικής έγκρισης/άδειας και ακολούθως εισηγούνται στην Ολομέλεια της Αρχής επί του αιτήματος της ΜΙΥΑ.