Όλα τα εισερχόμενα έγγραφα ψηφιοποιούνται, πρωτοκολλούνται, αρχειοθετούνται στην εφαρμογή διαχείρισης εγγράφων (Σύστημα Αυτοματοποίησης Δημιουργίας ΦΕΚ/ΓΕΝΙΚΟ ΠΡΩΤΟΚΟΛΛΟ). Στη συνέχεια ο υπάλληλος του Τμήματος Γραμματείας:
1. Τα εισερχόμενα σε ηλεκτρονική μορφή, τα αποστέλλει στην ηλεκτρονική διεύθυνση (e-mail) της Διεύθυνσης που απευθύνονται ή στο Γραφείο του Ειδικού Γραμματέα και τα καταγράφει - χρεώνει στο «ΒΙΒΛΙΟ ΔΙΕΚΠΕΡΑΙΩΣΗΣ».
2. Τα εισερχόμενα σε έντυπη μορφή τα καταγράφει - χρεώνει στο «ΒΙΒΛΙΟ ΔΙΕΚΠΕΡΑΙΩΣΗΣ» και τα δρομολογεί στις αρμόδιες Διευθύνσεις του Εθνικού Τυπογραφείου ή στο Γραφείο του Ειδικού Γραμματέα.