Η ΥΠΑ έχει το δικαίωμα μέσω των αρμοδίων οργάνων της να προβαίνει απροειδοποίητα σε ελέγχους τεχνικής εκμετάλλευσης και κατάστασης των ΣμηΕΑ των Εκπαιδευτικών Κέντρων. Επίσης, έκτακτοι έλεγχοι μπορεί να γίνονται στα εκπαιδευτικά κέντρα για την διαπίστωση της σωστής λειτουργίας αυτών. Τα όργανα ελέγχου της ΥΠΑ έχουν την υποχρέωση, εφόσον διαπιστώσουν παραβάσεις της κείμενης νομοθεσίας, των κανονισμών ή άλλες καταστάσεις που θέτουν σε κίνδυνο την ασφάλεια των πτήσεων, να εισηγηθούν για την λήψη απαραίτητων διοικητικών μέτρων, συμπεριλαμβανομένης της άμεσης απαγόρευσης πτήσεων των συγκεκριμένων ΣμηΕΑ ή και τη διακοπή λειτουργίας συγκεκριμένου εκπαιδευτικού κέντρου.